El Transformadors les sèries de pel·lícules van ser un punt d’inflexió en la carrera de Megan Fox. Va ser el paper més important que va aconseguir en el seu creixent camí cap a l'estrellat i semblava que la portaria a una ubicació permanent a la llista A de Hollywood. No obstant això, Fox va deixar la franquícia després de la segona pel·lícula.
Fox va interpretar a Mikaela Banes, a qui li encantava l'interès Sam de Shia LaBeouf a la pel·lícula dirigida per Michael Bay. Els dos van lluitar colze a colze amb els Autobots mentre els malvats Decepticons abandonaven el seu planeta natal i amenaçaven el benestar de la Terra. Al final de la segona pel·lícula, Mikaela i Sam es van declarar estimats els uns pels altres. Però per Transformers: Dark of the Moon , Sam sortia amb una nova noia anomenada Carly (Rosie Huntington-Whiteley), i el personatge de Fox estava absent.
Michael Bay mai ha tingut una reputació esterlina com a director de Hollywood; ha estat acusat d’exigir innecessàriament amb el seu repartiment i la seva tripulació a tots els platós. En una entrevista del 2009 amb Revista del País de les Meravelles , Fox va arribar famosament al rècord i va explotar Bay. Va dir a la publicació que Bay volia perpetuar la seva exigent reputació i va reprimir el plató, arribant a comparar-lo amb Hitler. D'acord amb Cosmopolita , Spielberg , que va ser productor al Transformador sèries, va sorprendre el comentari i li va suggerir que Bay la acomiadés.
En un 2011 GQ promoció d’entrevistes Foscor de la Lluna , la directora va respondre als seus comentaris bàsicament fent-los desaparèixer. Va dir que a Fox li agradava obtenir un augment de la gent i sempre ho feia de manera equivocada. Bay es va defensar, afirmant que simplement requeria que els seus actors es presentessin a temps i de tant en tant treballessin llargs dies al plató.
Després de ser acomiadat, Fox es va convertir en un paria a Hollywood durant un període de temps. A la Cosmopolita Fox va compartir el seu pesar pel seu comportament, dient que era el punt més baix de la seva carrera. Era jove (només tenia 23 anys) i creia que les seves accions eren justes. Però, mirant enrere, afirma que va ser una experiència d’aprenentatge massiva que va situar la seva carrera en una trajectòria completament diferent de la que tenia abans. En lloc de convertir-se en l'A-Lister que molts pensaven que seria, Fox es va instal·lar en una carrera més desenfadada. Va tenir un paper secundari a De Judd Apatow Això és 40 i un paper recurrent a la sitcom d'èxit Nova noia . Però si l’incident amb Bay mai no s’hagués produït, és possible que Fox hagués aconseguit més papers principals en pel·lícules i programes de televisió.
L’experiència de Megan Fox només ratlla la superfície dels foscos elements de treballar a Hollywood: es pot eliminar un error i un actor. Però el fil conductor és que Fox va aprendre del passat i sembla estar en pau amb la seva carrera professional. Casualment, Fox i Bay van tornar a treballar junts, encara que de manera indirecta. Fox va protagonitzar el reinici Tortugues ninja mutants adolescents pel·lícula, produïda per Bay.
