Mentre que els MCU Venjadors: Infinity War i Venjadors: Final del joc va reunir els herois de Marvel en dues de les superproduccions més grans de la història, Capità Amèrica: Guerra Civil va fer tot el contrari dividint l'equip en dues faccions contràries. Gairebé tots els venjadors presents a la MCU en aquell moment (diferents de Thor i Hulk) van aparèixer a la pel·lícula , però un grapat d'aquests herois van estar absents de l'esdeveniment original del còmic.
A continuació, es mostra una llista d’absents a la versió de còmic de Guerra Civil , juntament amb els motius de la seva absència.
Hawkeye
A la pel·lícula, Clint Barton s'havia retirat de la lluita contra el crim, però va respondre a la trucada del capità Amèrica sense cap pregunta. El seu homòleg de còmics es trobava en un lloc molt diferent en aquella època Guerra Civil. Després dels fets de Casa de M , que va veure a Scarlet Witch alterar la realitat i després restaurar-la només per acabar amb el 90% de tots els mutants, es creia que Hawkeye havia estat assassinat. No obstant això, Clint va tornar a la vida quan Scarlet Witch va restaurar la realitat. Durant els esdeveniments de la Guerra Civil, Clint vivia realment amb la Bruixa Escarlata.
Bruixa Escarlata
Després de les seves accions a Venjadors: desmuntats i Casa de M Wanda es va convertir en una amnèsica que vivia al petit poble de Transia, a prop de la muntanya Wundagore, on creia haver viscut tota la vida amb la seva 'tia Agatha'. Ella i Hawkeye van desenvolupar una relació íntima, tot i que aviat marxaria per convertir-se en Ronin.
Visió
Durant els esdeveniments de Venjadors: desmuntats Vision va perdre el control del seu cos, va alliberar quatre esferes que es convertirien en noves versions d'Ultron i després es va fondre. Els seus records es van incorporar a una versió sensible de l'armadura Iron Lad de Kang i es van convertir en 'Jonas'. Aquesta versió més jove de la Visió va ser la seva pròpia entitat que va lluitar al costat dels Joves Vengadors.
Ant-Man (Scott Lang)
Els efectes de la destrucció de la Bruixa Escarlata a Venjadors: desmuntats i Casa de M van ser de gran abast, ja que es va pensar que la destrucció de Avengers Mansion també va matar a Scott Lang, també conegut com Ant-Man. En realitat, Lang va ser arrencat de la mansió abans de la seva destrucció per la seva filla Cassie Lang i els Joves Vengadors. L’equip el va portar al futur, deixant als Vengadors d’aquella època a pensar que havia mort amb la mansió.
Soldat d’hivern
Tot i el seu paper central en la versió de MCU de Guerra Civil, el Soldat d’Hivern no va estar gens present a l’esdeveniment còmic. Després d'ajudar el capità Amèrica a defensar un atac terrorista a Londres, Bucky va fugir en lloc d'enfrontar-se al seu antic mentor i va demanar feina a Nick Fury. Durant la guerra, Bucky treballava encobert per a Fury, però planejava ajudar el capità Amèrica a escapar després que la seva rendició acabés la Guerra Civil. No obstant això, el Capità Amèrica va ser assassinat i Bucky li va robar l'escut de Cap a Tony Stark i va agafar el mantell del Capità Amèrica.
L’elenc d’herois de la pel·lícula i l’esdeveniment còmic no només va ser diferent, sinó que els esdeveniments ocorreguts abans i després de les dues guerres civils també són dràsticament diferents. En els còmics, les accions de Scarlet Witch van provocar l'absència d'ella mateixa i de tres herois més, la presència dels quals va poder haver alterat el resultat de l'esdeveniment. A la pel·lícula, Scarlet Witch només està aprenent l’abast dels seus poders i no té cap avaria fins molt de temps després dels esdeveniments de Guerra Civil . A la pel·lícula, tots aquests herois, a part de Vision, van lluitar al costat del capità Amèrica. És impossible saber-ho amb certesa, però pot ser per això que el Cap de l’MCU no va arribar a un final prematur al final de l’esdeveniment, com el seu homòleg de còmics.