Els creadors de sèries Carter Bates i Craig Thomas sabien exactament com volien Com vaig conèixer a la teva mare per acabar, fins i tot filmant escenes amb els nens de Ted anys abans que finalitzés el programa. Amb aquest repte, Bates i Thomas van haver d’omplir els buits entre el pilot i el final mantenint intacte el final. No obstant això, a mesura que la sèrie va créixer i els caràcters va evolucionar, el final previst va resultar agre per a molts fans que van seguir el programa des del principi i es va fer una petició per exigir una reescriptura.
La frustració va començar amb l'estrena de Com vaig conèixer a la teva mare és l'última novena temporada. Els showrunners van decidir adoptar un enfocament molt diferent amb la temporada 9; en lloc de fer-lo jugar durant tot un any d'esdeveniments, es basava en els tres dies anteriors i inclosos Barney i el casament de Robin. Tot i que la temporada va rebre crítiques mixtes per part del públic, va ser el final de la sèrie el que va crear la revolta més gran. Els dos darrers episodis van seguir la ruta habitual de finalització de la sitcom i van mostrar on seria el repartiment en el futur proporcionant fragments de les seves vides. Això també va mostrar a Tracy McConnell, també coneguda com La mare, que va morir per causes desconegudes. Quan l’episodi va acabar, els espectadors van veure a Ted i Tracy durant la seva primera reunió, fins a Ted el 2030 acabant la llarga saga de com la va conèixer.
Tot i això, la història no acaba aquí. Cap al començament de la segona temporada, Lyndsy Fonseca i Luke Henry, els actors que van interpretar a Luke i Penny Mosby, van filmar les escenes finals per tal de mantenir l’edat dels actors adolescents quan va arribar el moment de finalitzar el programa. A causa d'això, Com vaig conèixer a la teva mare Va acabar amb els nens que es van adonar que se'ls va explicar tota la història perquè poguessin donar permís al seu pare per sortir amb Robin perquè està enamorat d'ella. Li van donar permís i la sèrie acaba quan va començar, amb Ted dret davant de l'apartament de Robin, amb una tuba blava, demanant-li que li donés una oportunitat.
El motiu pel qual va frustrar molts espectadors va ser perquè la sèrie va al·ludir en diverses ocasions que Robin i Ted no funcionen. Van sortir només per una temporada abans de trencar-la i després van intentar reactivar la relació de nou anys després per adonar-se una vegada més que estan millor separats. Molts fanàtics van exigir que es tornés a connectar per aquest motiu, així com pel fet que la sèrie va passar anys construint una història d’amor molt millor amb Barney i Robin que va fer fondre els cors, mentre que tota la relació de Ted i Robin es va convertir en un simple pensament posterior.
No va ser fins al llançament del final alternatiu que els fans es van mostrar lleugerament satisfets. Talla completament la mort de la mare i les escenes amb els fills de Ted. Es mostra a Ted al seu casament envoltat dels seus amics amb la veu en off de Ted que resumeix el viatge i fins i tot al·ludeix al fet que Barney i Robin es tornaran a unir mentre que el final real només va donar un cop d'ull al públic. Aquest final alternatiu és el que els fans mereixien i necessitaven veure, i la majoria creuen que és el veritable.
Com vaig conèixer a la teva mare no va ser la primera sèrie amb un final decebedor i, certament, no va ser l'última, ja que va ser seguida pels desastrosos finals de Joc de trons i Sobrenatural que fins avui encara són perseguits per reescriure les seves últimes temporades. Malgrat això, el públic encara pot gaudir del viatge que es fa Com vaig conèixer a la teva mare, donat que troben el 'final alternatiu' per acabar amb una nota satisfactòria.
